Описаны общие характеристики и особенности проектно-исследовательских организаций с точки зрения системы менеджмента качества (СМК). На примере ОАО «ТомскНИПИнефть ВНК» рассмотрен вопрос описания проектно-исследовательской организации как «сети процессов» с их организационными единицами, входами, выходами и ресурсами. Приведена структурная схема автоматизированной СМК.